星际战甲内战需要打两遍，核心原因是任务分为现实战场与精神世界两个完全独立的阶段，且每个阶段的目标、机制与玩法截然不同，必须分别完整通关才能解锁完整剧情与指挥官全部能力。
首次推进内战任务时，流程聚焦于赤毒要塞的潜入与实战，玩家需操控战甲追踪泰辛魅影，突破Grineer的防线，逐步深入双子女皇的核心区域。此阶段以常规战斗为主，会遭遇大量库瓦精英守卫与重型单位，敌人拥有高额护甲与护盾，常规攻击难以快速破防，需利用战甲的范围伤害与控制技能清场。推进至女王房间后，会触发剧情强制分离指挥官与战甲，玩家被迫以指挥官形态进入精神世界，首次流程在此处中断，仅完成现实战场的前半段目标，无法直接击败双子女皇完成任务。
第二次推进则是精神世界的探索与能力觉醒，玩家以指挥官身份在记忆幻境中行动，解锁虚空弹射、虚空射线与传识等核心能力。此阶段无传统战斗，核心是解谜与剧情推进，需用虚空弹射跨越悬崖、摧毁冰墙，用虚空射线激活Orokin机关与阿耶檀识塑像，逐步解锁通往山顶的路径。抵达山顶完成与泰辛的对话，选择处置赤毒权杖的方式后，才能觉醒完整虚空力量，传识返回现实战场，此时才算开启内战的最终决战阶段。
回归现实战场后，玩法发生质变，需频繁切换战甲与指挥官形态对抗双子女皇。女皇的护卫处于无敌状态，必须先用指挥官的虚空弹射破防，才能用战甲输出击杀。破坏女皇周围的绸缎时，也需指挥官用虚空射线精准打断，重复数次后触发与泰辛的对决，击败后等待女皇护盾消失，再用指挥官虚空能力夺取权杖，最终完成任务。这一阶段是首次流程未触及的内容，也是解锁指挥官完整功能、赤毒玄骸玩法的关键前提。
任务机制设计上，首次流程仅为剧情铺垫与场景铺垫，未开放最终Boss战的完整机制，即便强行推进也无法触发结局动画。两次流程分别对应剧情的“分离”与“回归”，第一次让玩家失去战甲力量，第二次让玩家掌控真正的虚空之力，完整体验天诺战士的力量觉醒过程。同时，任务奖励与解锁内容仅在两次流程全部完成后发放，包括指挥官外观、特殊MOD与剧情道具，仅完成单次流程无法获取任何核心奖励。
