伤兵治疗是维持部队战斗力的核心机制。当武将受到伤害时，损失兵力的90%会转化为伤兵进入伤兵队列，未治疗的伤兵每回合会自然死亡10%，战斗结束时未治疗的伤兵会再损失30%。治疗类战法只能恢复伤兵队列中的兵力，无法挽回已阵亡的士兵。及时有效的治疗是降低战损的关键。
治疗手段主要分为战场即时治疗和战后自动恢复两类。战场治疗通过战法实现，包括指挥类、主动类和被动类三种形式。指挥类如刘备的仁德载世每回合稳定恢复兵力；主动类如刮骨疗毒需触发发动概率但治疗量较高；被动类如自愈无需发动条件但恢复量固定。战斗中治疗时机尤为重要，慢速武将携带治疗战法能覆盖更多伤兵，而高速武将适合搭配解控类战法防止治疗被中断。
主城或分城的医馆是战后自动恢复伤兵的基础设施，其等级决定同时治疗的数量和速度。联盟科技中的伤兵治疗加速、资源产量提升等研究项目能间接提高治疗效率。当城门被攻破时，所有伤兵将无法恢复，因此在防守战中需优先保护城门安全。
智力型武将更适合携带属性加成的治疗战法，如诸葛亮使用杯蛇鬼车可发挥高智力优势；武力型武将则适合倒戈类吸血战法，如董卓的鲁莽在造成伤害时同步恢复。鲁肃的济贫好施能在特定回合转移兵力，兼具治疗与减伤效果。建议将治疗武将置于队伍后排，避免因兵力骤减导致治疗量下降。
治疗伤兵需消耗粮食资源，在频繁作战时需保持粮草储备。分城和营帐的合理布局能缩短部队返回时间，减少伤兵在行军中的自然损耗。使用资源卡补充短缺、联盟成员协助加速治疗等手段，都能在资源紧张时提供应急方案。
