忍者的选择需要综合考虑强度、操作难度和适用场景。A级忍者中，青水、骨架和黑土属于第一梯队，技能机制优秀且易于上手，适合新手快速适应决斗场节奏。其中青水以灵活的位移和稳定的连招著称，骨架则凭借抓取技能和霸体效果在对抗中占据优势。而老牌忍者如晓鼬、神卡等虽有一定强度，但机制稍显落后，需谨慎选择。S级忍者普遍拥有更高的上限，但部分角色如秽土鼬对操作要求较高，需根据自身技术储备决定是否投入资源。
具备抓取、霸体或多段位移的忍者往往能主导战局，例如百战宇智波鼬的普攻节奏流畅，前三段可快速贴近敌人，配合八坂之勾玉和天照形成压制。而阿飞的地雷原术能通过空中飞行实现消耗，搭配秘卷扦插之术可打出高额爆发。需注意，部分忍者存在明显克制关系，例如阿飞对地面技能型忍者优势显著，但易被空中技能打断，实战中需根据对手调整策略。
通过冒险副本、小队突袭等PVE玩法积累铜币和经验，初期集中强化1-2名主力忍者。声望可通过试炼之地、组织叛忍等途径提升，用于解锁高阶天赋。体力管理同样关键，每日购买次数有限，需合理分配至碎片掉落率高的关卡。组织玩法中的迎击叛忍和祈福密令能提供额外资源，建议尽早加入活跃组织以加速成长。
替身术的释放时机、通灵兽的反手应用以及秘卷的针对性搭配均能影响胜负。例如雷击秘卷适合起手打断，水龙卷则用于应对敌方替身后的反扑。保护机制的存在要求连招时控制伤害阈值，避免过早触发倒地保护。对于网络延迟问题，可通过调整战斗节奏或选择容错率高的忍者缓解，如百豪樱的抓取技能不易受延迟影响。
