海空军的补给是维持战斗力的核心机制，其补给方式与陆军存在显著差异。空军部队的补给主要依赖航空母舰的舰内补给功能，当飞机返回航母后可自动恢复弹药和燃料；海军舰船则需停靠己方港口或使用特定策略进行补给。空军单位若长时间脱离航母作战，会因补给耗尽丧失战斗力，因此需要规划好作战半径与返航路线。
海军的补给逻辑更为复杂，除常规港口补给外，还可通过空投补给策略为远离基地的舰队提供紧急支援。航空母舰作为移动补给平台，不仅能补给舰载机，还能为护航舰队提供有限支援。游戏中的补给系统会实时显示部队的补给状态条，当状态低于30%时会触发移动速度下降等负面效果，需优先处理。不同舰载机类型的补给消耗速率各异，例如轰炸机的弹药消耗速度明显高于侦察机。
补给策略卡的使用时机直接影响战局走向。空投补给作为史诗级策略，能瞬间恢复指定区域内所有海空军单位的50%补给值，但存在6小时冷却时间。军团城市解锁的战略空投功能可扩大补给范围，这对跨海域作战尤为重要。游戏后期研发的高效补给科技能减少20%的补给消耗，建议优先升级。需被敌军包围的部队无法接收空投补给，必须先行突围。
在己方领海范围内，海军单位的自动补给速度提升30%；而机场跑道等级决定空军单次补给量，满级跑道可使战斗机载弹量翻倍。深海区域会延缓补给运输速度，建议建立中途补给链。历史战役模式中的特殊天气，如暴风雨会中断补给线12小时，需提前储备物资。侦察机单位的特殊技能战场勘测可临时扩大补给接收范围。
补给系统的微观管理涉及多个界面交互。在空军基地界面可查看各中队剩余作战时长，精确到分钟；海军编队界面则显示当前补给品构成比例。高级设置中可开启自动返航功能，当补给低于15%时单位会自动撤回最近补给点。军团仓库的战略储备分页能预先配置不同类型的补给包，包括针对轰炸机的高爆弹药包和鱼雷艇专用的快速补给包。研发中心的后勤学分支科技可解锁更多补给方案。最后需要强调补给与战术的协同关系。大规模海空联合行动前，务必在行军路线上预设补给节点。夺取敌方机场或港口后，需等待2小时系统重置才能用作补给点。
