在少年三国志2后期阶段，阵容搭配直接影响战斗胜负。马超作为输出核心的阵容表现突出，搭配千幻左慈、闭月貂蝉、耀武华雄及陷阵高顺，形成兼具爆发与控制的高效组合。这套阵容通过左慈和貂蝉的控制技能为马超创造输出环境，华雄和高顺则提供坚实的前排防御，适合快速击破敌方后排脆皮角色。
蜀国赤金阵容以赤金赵云和赤金张飞为核心，配合庞统等蜀国武将，展现出强大的持续作战能力。赵云的高爆发伤害与张飞的反击输出相辅相成，庞统的回怒效果确保技能循环流畅。该阵容特别克制依赖控制或高频攻击的对手，通过羁绊加成进一步提升整体战力，在持久战中优势明显。
灼烧队是另一种值得关注的后期阵容，以赤金周瑜和紫金鲁肃为基础，搭配孙坚、孙鲁班及太史慈。这套阵容利用百分比灼烧伤害消耗敌方血量，当目标生命值降至50%以下时，孙坚和太史慈的斩杀能力可快速终结战斗。周瑜和鲁肃还提供额外控制与治疗，增强队伍生存能力。
周泰消耗阵容采用不同战术思路，以不屈周泰为核心构建防御体系，配合耀武华雄、英风祝融等武将。该阵容依靠周泰的高防御与回复能力承受伤害，其他成员持续施加减益效果，通过持久战逐渐消耗对手。这种打法在面对爆发型阵容时表现优异，但需要玩家具备耐心和精准的时机把握能力。
